本发明公开了鉴定棉花品种YM111真实性和种子纯度的引物组及其应用。本发明的鉴定棉花品种YM111真实性和种子纯度的引物组,是由NAU1071、NAU1085、NAU1102、NAU1186、NAU1042、NAU2026、NAU2274和NAU879这8种引物对组成的组合物。这8种引物对组成的组合物可以用于鉴定棉花杂交种YM111的制种纯度,鉴定棉花杂交种YM111品种的真实性,构建棉花杂交种YM111品种的指纹图谱。运用这8种引物对组成的组合物,可以控制杂交棉YM111的制种质量,有利于YM111的推广和保护。