发明专利
| 基本信息 | |
| 标题 | 基于转录组测序开发绿豆SSR引物的方法 |
| 申请日 | 2013年11月29日 |
| 申请专利权人 | 188bet平台app官方 作物科学研究所 |
| 发明设计人 | 陈红霖;程须珍;王素华;王丽侠 |
| 摘要 | 本发明提供一种基于转录组测序开发绿豆SSR引物的方法，包括：获得绿豆全基因组转录本的集合，形成序列数据库；用Trinity将测序序列拼接成一个转录组，取每条基因中最长的转录本作为Unigene；Unigene序列生物信息学分析；采用MISA1.0对Unigene进行SSR检测；用Primer3进行SSR引物设计，并进行SSR引物多态性鉴定。应用本方法成功设计了13134对SSR引物，从中随机选取50对引物对来源于不同国家共8份绿豆DNA进行验证，其中多态引物共有32对，利用这32对SSR引物可以区分不同地理来源的绿豆材料。本发明方法方便、快捷、准确且成本低廉，为绿豆SSR引物开发提供了新思路。 |
| 授权公告号 | CN103642912B |