为了适应全面建设小康社会和科技体制改革的需要，根据科技部、财政部、中编办的批复精神，经农业部批准，我院在原子能利用研究所学科调整的基础上，整和相关研究所农产品加工研究方面的力量，新组建了国家级综合性的农产品加工研究所。
　　成立农产品加工研究所，把农产品加工作为我院重点发展的九大学科领域之一，是院党组科技体制创新的又一重大举措。目前已投资1000万元，改造和建设相关的实验室，增加农产品加工的仪器设备，首批500万元的仪器设备已全部到位，食品科学大楼和中试中心建设正在规划之中。
　　12月19日，农产品加工所揭牌仪式在京举行。揭牌仪式由屈冬玉副院长主持。农业部张宝文副部长、科技部计划司申茂向司长及我院翟虎渠院长、加工所魏益民所长先后致辞。张宝文、翟虎渠还共同为农产品加工研究所揭牌。参加揭牌仪式的还有科技部生物工程中心主任王宏广、国家技术监督检验检疫总局国家标准化管理委员会副主任孙晓康、农业部科技发展中心主任段武德、科教司副司长杨雄年、中国农业大学常务副校长江树人、中国农学会秘书长陈建华、中国粮油学会副会长刘兴信和有关单位的领导和专家，以及我院章力建、刘旭副院长，党组成员、人事局局长司洪文和院机关各职能部门、京区各研究所的领导等近200人。
　　在致辞中，翟虎渠要求，农产品加工研究所要抓住机遇，加快改革，立足创新，刻苦攻关，不断发展，将该所构建成为现代化的、具有农业产业背景和农产品加工特色的食品科学与工程的研究、试验、中试基地，食品工程技术的孵化基地，农产品产业化开发的示范基地和食品科学与工程人才的培养基地。
　　作为从事农产品加工技术和食品科学技术研究的惟一国家级科研机构，研究所将围绕我国产业结构调整和农业产业化的关键技术需求，结合农业生产、食品科学和居民消费特点，利用生物技术、工程技术、核技术等高新技术手段，研究和解决农产品加工、贮运、安全及食品科学关键技术问题，以加快我国食品和农产品加工业的发展。与此同时，通过食品科学与工程一级学科和食品科学、粮食油脂及植物蛋白工程、农产品贮藏与加工工程学科博士点、硕士点的建设，培养食品科学与工程专业的高级科技人才。
　　研究所设有食品科学实验室、农产品加工工程中心、农业部核技术与农产品加工重点开放实验室、中国农业辐照中心、农业部辐照产品质量监督检验测试中心等研究和开发部门；拥有农产品质量与食品安全、生物物理学博士点、农产品贮藏与加工工程硕士点。